COMO Enriquecer A Discussão Do SEU Estudo? Uso de bases de dado

“COMO ENRIQUECER A DISCUSSÃO DO SEU ESTUDO? Uso de bases de dados na web para auxiliar na compreensão biológica dos seus resultados”



PROFESSOR:

Igor Araujo Vieira



SOBRE A PALESTRA:

Capacite-se sobre as principais ferramentas e bancos de dados online que podem contribuir para um melhor entendimento dos resultados do seu estudo (projeto e/ou artigo de pesquisa experimental), bem como podem enriquecer os pontos da sua discussão e possibilitar o surgimento de novas hipóteses de pesquisa.

- Adquirir conhecimentos sobre os principais bancos de dados acerca de genes, seus produtos funcionais e doenças relacionadas, bem como aqueles que descrevem a sequência referência de ácidos nucleicos e proteínas;

- Assimilar quais são as principais ferramentas online disponíveis para encontrar dados de expressão gênica, de interação entre genes e proteínas, de vias de sinalização celular, de estruturas e domínios funcionais de proteínas, além de databases que compilam informações sobre variantes genéticas (germinativas e somáticas) e fontes de dados validados e preditos computacionalmente relacionados às interações miRNAs-alvos;

- Compreender como as bases de dados podem enriquecer a discussão dos dados obtidos no seu estudo.



CONTEÚDO PROGRAMÁTICO:

- Informações sobre genes, seus produtos funcionais e implicações clínicas: GeneCards, WikiGenes, OMIM, HGNC (HUGO Gene Nomenclature Committee), The Human Protein Atlas e MalaCards;

- Busca por sequências de genes, RNAs (codificantes e não-codificantes) e proteínas: NCBI (Genome, Nucleotide, Gene, Protein, entre outros), UniProt e Locus Reference Genomic (LRG);

- Bancos de dados de expressão gênica (global e/ou tecido-específica): Gene Expression Omnibus (GEO), ArrayExpress, The Cancer Genome Atlas (TCGA), CbioPortal, BioGPS, Gene Expression Atlas e GTEx;

- Dados de interação entre genes e proteínas: STRING, STITCH, BioGRID e GeneMania;

- Análise de processos biológicos e vias de sinalização celular: KEGG Pathways e Gene Ontology;

- Informações sobre estruturas e domínios funcionais de proteínas: PDB, Pfam, InterPro e Prosite;

- Ferramentas para diferentes tipos de busca sobre variantes genéticas (frequência populacional, diretrizes para nomenclatura adequada e classificação): NCBI (SNP), ClinVar, dbSNP, dbVar, Leiden Open Variation Database (LOVD), 1000 Genomes Project, Genome Aggregation Database (gnomAD), Exome Aggregation Consortium (ExAC), Arquivo Brasileiro Online de Mutações (AbraOM), FLOSSIES, Human Genome Variation Society (HGVS) e InterVar (interpretação clínica de variantes genéticas);

- Algoritmos in silico para avaliação da patogenicidade de variantes genéticas: M-CAP, PredictSNP, Mutation Assessor, Mutation Taster, SIFT, PolyPhen-2, Align GVGD, S-CAP, Human Splicing Finder, BDGP, entre outros;

- Catálogos de mutações somáticas em diferentes tipos de câncer: TCGA, CbioPortal e COSMIC;

- Ferramentas de predição de sítios-alvo para ligação de microRNAs e bancos de dados de interações miRNAs-mRNAs alvos validadas experimentalmente: miRecords, miRTarBase, starBase, TarBase, Target Scan Human, DianaMicroT, MicroCosm Target, miRanda, PITA e RNAhybrid;

- Dados sobre compostos químicos e/ou de interesse farmacológico: Promiscuous, PubChem, DrugBase, PharmGKB e ChEMBL;

- Busca sobre resultados de ensaios clínicos: ClinicalTrials.gov.



PÚBLICO ALVO:

LIVRE.



CARGA HORÁRIA:

- 1h30min.



INVESTIMENTO:

R$ 45,00



INFORMAÇÕES ADICIONAIS:

– Certificado impresso e fornecido ao final do curso.

- Necessária a apresentação do documento de identidade.

* Cancelamentos podem ser solicitados no prazo máximo de 7 dias após a data da compra, assim será garantido o reembolso do valor pago (Art. 49 do Código de Defesa do Consumidor - Lei 8078/90).

**Reembolsos, cancelamentos e transferências de créditos não estão previstos e assegurados após este período ou em caso de não comparecimento no dia do evento.



DATA E HORÁRIO:

- Dia: 23 de novembro de 2019 (sábado).

- Horário: 17h30min às 19h.

* Local, data e horário sujeitos a alteração conforme fechamento da turma.



LOCAL:

CIEE – Rua Dom Pedro II, nº 861, sala 3, Bairro Higienópolis, Porto Alegre/RS.

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